核酸檢測已成為現代醫學診斷的黃金標準,特別是在傳染病防控中發揮著關鍵作用。快速、精準、低成本是核酸檢測技術的核心需求。
傳統的方法如RT-qPCR技術雖精準但存在明顯局限性:需要復雜的儀器、專業操作人員和實驗室環境,操作復雜且耗時久,難以在資源有限地區推廣應用。而無細胞診斷平臺因其操作簡便、無需活細胞培養等優勢,已成為核酸檢測的重要方向。
今天小編和大家分享一篇中國-第三軍醫大學西南醫院發表在Nature Communications上的一項突破性成果——TRACKer(Target-Responsive non-preAmplification Cell-free diagnostic Kit),一種低成本、可擴展的解決方案。研究團隊憑借CFPS(無細胞蛋白表達)技術將整個檢測流程壓縮至70分鐘(CFPS試劑盒來自蘇州珀羅汀生物技術有限公司)。


文獻鏈接:nature.com/articles/s41467-026-71684-6
一、研究背景:傳統核酸檢測的三大困境
呼吸道病毒無處不在,是人類社會中最常見、傳播廣的傳染病之一。當前呼吸道病毒核酸檢測技術,難以同時滿足精準定量與快速篩查的雙重需求,核心痛點包括:
依賴預擴增,流程繁瑣:RT-qPCR、LAMP 等技術需先擴增靶標核酸,不僅耗時,還容易造成污染,且需專業實驗室與溫控設備,基層與現場難以開展。
通用性差,設計成本高:主流無細胞核糖調節器(如 toehold 開關)需針對每種病原體重新建模、反復實驗優化,開發周期長、擴展性差,無法快速適配多種病毒檢測。
靈敏度與便攜性難兼得:快速抗原檢測雖然便攜但靈敏度低;高靈敏度核酸檢測又離不開大型儀器,難以實現 “即時、精準" 檢測。
二、TRACKer 技術:核酶開關 + 無細胞表達
TRACKer是基于從頭設計核酶調控的無細胞診斷平臺,其在同一檢測體系中結合了核酶切換與互補鏈置換技術(圖1)。得益于CFPS(無細胞蛋白表達)技術,無需預擴增即可達到Attomolar級別的靈敏度。此外,研究團隊針對6 種常見呼吸道病毒,系統驗證了 TRACKer 性能。

圖1:TRACKer技術概述
2.1 模塊化設計靈活適配(圖2)
核酶變構模塊:基于 HH15 核酶設計,通過鏈置換介導核酶構象切換,實現通用靶標識別。無靶標時,IRS 鏈結合核酶抑制其活性;靶標 RNA 存在時,靶標與 IRS 特異性結合,置換 IRS 并激活核酶。
核糖調節器激活模塊:激活的核酶切割底物,暴露核糖體結合位點(RBS),啟動CFPS體系中報告蛋白級聯表達,將單個靶標識別事件放大為大量報告分子,實現無預擴增高靈敏度檢測。
輸出模塊:支持雙模式信號輸出,實驗室場景用 HiBiT 發光報告(精準定量),現場場景用 Flag-His 雙標簽肽(側向層析試紙條可視化),無需儀器即可肉眼判讀。

圖2:TRACKer 的從頭設計
2.2 CFPS極簡反應,70 分鐘全程可控
TRACKer 檢測流程高度簡化,臨床樣本僅需 4 步即可完成檢測,全程 < 70 分鐘:
樣本處理:提取臨床咽拭子樣本病毒 RNA(15 分鐘);
靶標識別:RNA 與 TRACKer 探針31℃孵育,靶標激活核酶(20 分鐘);
信號放大:加入CFPS體系,25℃啟動報告蛋白合成(40 分鐘);
信號讀取:實驗室測發光值,現場用側向層析試紙條肉眼判讀(5 分鐘)。
2.3 性能驗證:阿摩爾級靈敏度,六大病毒通吃
研究團隊針對6 種常見呼吸道病毒(甲流 FluA、乙流 FluB、呼吸道合胞病毒 RSV、人鼻病毒 HrV、副流感病毒 HPIV、新冠 SARS-CoV-2)系統驗證 TRACKer 性能,各項指標均達前沿水平。
靈敏度:通過將CFPS合成的級聯放大技術與HiBiT輸出模式相結合,實現了高靈敏度檢測,對 6 種病毒的檢測限(LOD)低至1-10 阿摩爾(aM),可直接檢測微量病毒 RNA,無需預擴增,靈敏度比快速抗原檢測高且與 RT-qPCR 相當。
特異性:僅識別對應靶標 RNA,非靶向病毒RNA產生的信號始終維持在與陰性對照相當的基線水平;單個堿基錯配即可顯著降低信號,末端錯配抑制效果更強,可精準區分病毒亞型與突變株。
正交性:6 種病毒特異性 TRACKer 系統互不干擾,無交叉激活,支持多病毒聯合檢測,適合呼吸道感染綜合征篩查。

圖3:TRACKer對呼吸道病毒靶標的檢測能力
2.4 臨床驗證:與 RT-qPCR 一致性最高 100%
研究團隊用188 例臨床咽拭子樣本(FluA 56例、RSV 42 例、HrV 90 例)驗證 TRACKer 臨床性能(圖4),TRACKer所依賴的CFPS系統展現了出色的可靠性與一致性。
FluA:靈敏度 100%,特異性 94.8%;
HrV:靈敏度 90%,特異性 92%;
RSV:靈敏度 88.9%,特異性 96.4%。
與細胞內翻譯相比,CFPS系統省去了將DNA遞送入細胞、轉錄等前置步驟,也避免了細胞膜的通透性屏障。反應組分預先混合好,靶標RNA的加入直接觸發級聯反應,翻譯機器幾乎立即開始工作。

圖4:TRACKerassay在實驗室環境中的臨床驗證
三、未來展望
從“Toehold Switch"到如今的“TRACKer",合成生物學正在一步步走出實驗室,走進我們的生活。這項由中國團隊主導研發的成果,利用CFPS技術,成功破解了“高靈敏度"與“快速便攜"不可兼得的難題。
在2026年的今天,當我們面對復雜的呼吸道病毒威脅時,不再需要在“快"與“準"之間做選擇題。TRACKer技術告訴我們,通過重新編程生命的底層語言(RNA)并利用體外蛋白表達,我們有可能構建出既靈敏又便捷的下一代診斷工具。這不僅是技術的勝利,更是人類對抗疾病上的一座新里程碑。
珀羅汀生物很榮幸能夠為該高影響力研究提供關鍵實驗材料支持,并將繼續致力于提供高質量的無細胞蛋白表達試劑、無細胞蛋白表達服務以及高通量篩選相關產品,為基礎研究和應用創新提供助力。
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